玉米茎腐病致病菌全基因组分泌蛋白预测与分析

发布日期：2025-02-15

作者：曹言勇， 张立立， 李慧敏， 韩胜博， 侯梦薇， 段灿星， 施艳， 张新友

摘要：九州镰孢菌(Fusarium kyushuense)是一种重要的植物病原菌,可引起玉米茎腐病.为明确九州镰孢菌的分泌蛋白,运用SignalP 6.0、ProtComp 9.0、TMHMM 2.0、big-PI Predictor、TargetP 2.0等软件对九州镰孢菌全基因组12 225条蛋白质序列进行分泌蛋白的预测和筛选.结果表明,九州镰孢菌195全基因组蛋白中共有539条序列具有典型的分泌蛋白特征,占总序列数的4.41％.信号肽-3和-1位置的氨基酸相对保守,其切割位点属于A-X-A型.分泌蛋白功能注释分析结果表明,九州镰孢菌的分泌蛋白中共有264个效应蛋白,其功能主要涉及细胞壁组分降解.对碳水化合物活性酶类(CAZymes)进行预测发现,九州镰孢菌分泌蛋白组中共有168个碳水化合物活性酶,为进一步探究其生物学特性、致病机制和筛选新的镰孢菌致病效应蛋白奠定基础。

来源：玉米科学,2024,32(4):110-118. DOI:10.13597/j.cnki.maize.science.20240414